复合土工膜铺设时由坡肩自上而下滚铺至坡脚，中间不应有纵向连接缝。渠坡和渠底结合部以及和下段待铺的复合土工膜部位要预留足够的搭接长度，一般控制在50～80cm，坡肩处预留复合土工膜的长度应满足设计要求。铺设过程中可用编织袋装土覆压，随铺随压，以防止复合土工膜滑移。使复合土工膜幅宽与渠道中心线垂直。渠底复合土工膜间横向连接缝与坡面复合土工膜接头缝均应相互错开100cm以上。铺设齿槽部位的复合土工膜时，应松弛适度，且与齿槽贴紧，铺设完毕后及时用临时支撑固定保温板和土工膜。支撑约2m左右一个，待混凝土浇筑满槽后取出，清理干净待用。复合土工膜裁剪应整齐平顺，并保证足够的搭接宽度。遇到建筑物墩柱时根据建筑物尺寸在复合土工膜上进行标识，根据标识线进行裁剪，标识尺寸应考虑与建筑物的粘结宽度。
复合土工膜与墩、柱、墙等建筑物须进行粘接，粘接宽度不小于设计要求，建筑物周围复合土工膜应充分松弛。为保证土工膜与建筑物粘结牢固，防水密封可靠，在对土工膜或墩柱进行涂胶之前，应将涂胶基面清理干净，保持干燥。涂胶均匀布满粘结面，无过厚、漏涂现象。在粘结过程和粘结后2h内，粘结面不得承受任何拉力，严禁粘结面发生错动。
缝合底层土工布、热熔焊接或粘接中层土工膜、缝合上层土工布。
